SVA genomför riskvärderingar som ett led i det vetenskapliga arbetet. De kan genomföras som forskningsprojekt eller genom uppdrag från regering, andra myndigheter eller organ. SVA utför riskvärderingar inom de fackområden som myndigheten företräder bland annat smittsamma djursjukdomar och zoonoser.

Riskvärdering är en del av en större process, riskanalys. Riskanalysen innehåller definierade delar såsom riskidentifiering, riskvärdering, riskhantering och riskkommunikation.

Riskvärdering är ett verktyg i syfte att möjliggöra hantering av risker. Risk definieras vanligen som sannolikheten för och konsekvenserna av en oönskad händelse. Syftet med riskvärderingar är att presentera en objektiv bedömning av risker baserat på tillgänglig kunskap det vill säga, evidensbaserat.

En riskvärdering kan vara kvantitativ eller kvalitativ. En kvantitativ riskvärdering bygger på matematiska och statistiska metoder där resultatet av bedömningen uttrycks i numerär form, medan utfallet av en kvalitativ riskbedömning uttrycks i kvalitativa termer såsom till exempel hög, låg eller försumbar risk för en viss händelse. Osäkerheten och variationen kring resultatet uttrycks vanligen i konfidensintervall eller felmarginal. Med ett 95 procents konfidensintervall menas att det sanna värdet ligger med 95 procents sannolikhet mellan de två angivna värdena. Ett stort intervall innebär en större osäkerhet i resultatet än ett resultat med ett snävt konfidensintervall.