Smittspårning av kvarka med molekylärbiologiska metoder

I det föreliggande projektet avses att undersöka samtliga svenska indexfall av kvarka under ett års tid jämte ett urval från tidigare utbrott, med helgenomsekvensering av S. equi samt insamling av demografiska, geografiska och anamnestiska data. Data genereras för karakterisering av stammar och smittspårning som ger underlag för relevanta strategiska bekämpningsinsatser. .

Syftet med studien är att ge svar på följande frågeställningar:
a) om de svenska utbrotten av kvarka idag i huvudsak beror på återkommande nyintroduktion av kvarka från utlandet, och/eller om det förekommer betydande cirkulation av samma eller liknande stammar inom landet, samt
b) om cirkulerande stammar i Sverige matchar det vaccin mot kvarka som finns att tillgå.

Förväntad nytta är att skapa ett viktigt underlag för riskvärdering och riskhantering, vilket har avgörande betydelse för att skapa rätt inriktade förebyggande åtgärder, så som relevant riktade strategiska insatser för att upptäcka och stoppa smittspridning, liksom monitorering av antigen drift vad gäller antigen som används för vaccin mot kvarka.